陈嘉庚是侨居新加坡、闻名南洋的实业家、著名的爱国华侨领袖。毛泽东、陈嘉庚分别作为中共领袖与海外华侨领袖，在抗日战争中相识相交，他们同舟共济、肝胆相照致力于新中国的建立和建设大业，在他们的交往中还有关于黄帝陵保护的故事。
陈嘉庚曾两次来陕西祭拜黄帝陵，第一次是在抗日战争期间作为爱国华侨领袖赴延安慰问途中，率领随行人员谒祭黄帝陵；第二次是担任第二届全国政协副主席，在访问西北途中拜谒黄帝陵和轩辕庙。
据《南侨回忆录》记述，1940年５月30日晨，陈嘉庚一行由西安出发，中午到三原县午餐，傍晚到宜君县住下。第二天早上启程，他们一行 “遥见山坡上树木茂盛，异于其他诸山”，8时到中部县（即黄陵县）。在县长同陪下登桥山到达黄帝陵，见到陵墓“系土堆，略作圆形，面积不过2000方尺，高约20尺。”陵前建一亭，约２丈方，高１丈余，标“轩辕桥陵”，无石刻物等项。陵前香案上排列果品，陈先生焚香行祭拜礼，摄影留念，并肃立亭阶上演说，大意是南侨慰劳团代表南洋千万华侨拜谒始祖，回国慰劳考察，是为鼓励抗战民气，并要把获得的国内军民抗战的信息，带到海外去宣传，以争取更多抗战援助。随后陈先生一行登汉武帝祈仙台观赏陵景。陈嘉庚对黄帝陵之“风水”颇为赞赏，他写道：“由桥陵观之，岂三代以上黄帝时代，便有笃信风水者，不然如桥陵后方有高山起伏形势，其左右前后处处有水流环抱，近代迷信风水者所言之吉地，诚无出其右也。”
1955年9月，全国政协副主席陈嘉庚在访问西北途中，第二次来到桥山拜谒了黄帝陵和轩辕庙，看到黄陵年久失修。遂于10月9日致信毛泽东，信中说，我此次访问西北，途经黄陵县时，顺便拜谒黄帝陵和轩辕庙。院中历代石碑犹在，知年古柏森森，惟庙宇木料多已腐坏，抛将倾塌，庭中草地，多为农民耕种。陵山多数私坟如鳞，曾查询县长，据说自解放后至今未派人看管。保护山陵标语虽有，但徒有虚名。黄帝陵乃我中华民族历史遗迹。解放后人民政府对历史文物及各处寺庙尚且保护，而黄帝陵竟任其荒废，抑或中央主管部门，因偏僻未暇顾及。毛主席接信后即在原信上批示：“周总理，此件阅，请批交有关机关处理。我看陈先生的提议是有道理的。”（《建国以来毛泽东文稿》第五册，第431页）
陈嘉庚的直言建议，得到了毛泽东的高度重视。在毛泽东和周恩来的直接关怀下，1956年，黄帝陵祭祀亭得到整修，陵墓外新筑砖花墙，庙院内“手植柏”、“挂甲柏”新作木栅栏，黄帝陵景区面貌焕然一新。
