黄帝陵祭祀多年来一直倍受中、省、市、县重视，在相关部门的大力支持下，作了大量的工作，但仍存在着不少难以解决的问题：
（一）随着社会的不断发展，一些传统的祭祀活动日益淡化，对黄帝的祭祀只注重“形祭”而忽视了“心祭”。
（二）对于公祭黄帝近年来有些学者提出了不同看法，把今日的黄帝祭祀活动与宗教迷信简单地等同起来，这说明我们在对黄帝文化的研究探索上只是形式上的重视，而不能从理论上，宣传力度，内涵上下功夫。
（三）一些在黄帝祭祀，尤其是民祭上的傧相、主事，因年事已高，逐步退出，一些传统礼仪在继承上出现断档，后继人才缺乏。
（四）随着科技的进步和市场经济的发展，人们的文化生活日益丰富，审美需求提高,对和黄帝陵祭祀相关的当地民俗文化（如剪纸、面花、木雕、乐队、礼宾）愈来愈淡漠，传统手工艺制作人才匮乏，青黄不接，虽然也举办过培训班，但效果不大。
