距今约9000年至7000年的新石器时代中期，黄河中下游和长江中下游开始成为各具特征的两大农业地区。这一时期，聚落规模有所扩大，有些聚落已经有环壕。聚落布局体现凝聚式和向心式特点。这一时期陶器的制作水平有显著提高，种类有所增加，包括碗、钵、盆、罐、瓮、盂、缸、小口类底器、小口平底以及大口尖底器等许多品种，涉及饮食器、储藏器、水器和炊器等多种类型。当时陶窖的温度在900－1000摄氏度之间，由于氧化作用，出窖的陶器呈红色、器面上的图案则为黑色，这样的陶器被称为彩陶。编织技术已达到一定水平，有斜纹缠结、棋盘格式、间格纹等多种编织方法。
距今约7000年至5000年的新石器时代晚期是中国种植农业的迅速发展时期。在黄河流域，种植业已经成为主导性的经济部门，当时谷物收获量已相当可观。半坡晚期的115号窖穴中堆积的粟的朽灰，折算成新鲜小米有500多公斤。山东胶县三里河一座大汶口文化晚期的窑穴中堆积的粟的朽灰，折合成新鲜小米约有2000公斤。长江流域的浙江余姚河姆渡遗址（距今约7000－6500），在第一次发掘的400多平方米的范围内，发现由稻谷、稻壳、芦苇茎叶等混杂而成的堆积层，厚度不等，大多10～40厘米，最厚处达80厘米。专家推测，假定当时的堆积层平均厚度为1米，其中1/4为稻谷和稻壳，则此处堆积的稻谷的重量至少有120吨。说明河姆渡人的粮食不仅可以满足食用，而且已经有较多的剩余。河姆渡遗址还出土了270余件大型偶蹄类哺乳动物的肩胛骨，大多是水牛的肩胛骨，臼部经过锉削，正面的左右各凿有一个长方形孔，有些肩胛骨出土时还残留着用藤条穿过方孔捆缚住的木柄，可见原本是铲类农具，专家将其定名为“骨耜”，是与当地沼泽型地貌相适应的锄草、翻土、排水用的工具。与骨耜同时出土的农具，还有用动物肋骨制作的骨镰、中耕农具鹤嘴锄和加工谷物用的木杵等，表明河姆渡人早已渡过了“刀耕火种”的落后状态，进入到了使用成套农具、普遍种植水稻的“熟荒耕作制”阶段。这一时期的聚落规模一般在1—6万平方米之间，一般居住80—600人，最大的聚落估计达到数万人。此时聚落环壕设施增多，每个聚落均有居住区和墓葬区，有的还有陶窖区。墓葬区与居住区的聚落、房群、房组三级结构相对应，形成墓地、墓区、合葬墓三级结构，几个合葬墓构成一个墓区，几个墓区构成一个聚落的墓地。在甘肃秦安大地湾遗址中还出现了面积很大、规格很高的大型房子。在红山文化中出现了像牛河梁那样的贵族墓地，每座墓不但用大石板砌坑，随葬玉器等精美物品，而且在上面修筑巨大的积石冢。 陶器制作进入全盛时期。无论是中原仰韶文化、山东的大汶口文化，还是长江中游的大溪文化、燕辽地区的以红山文化，都有非常发达的彩陶。仰韶文化出土的彩陶器、陶土经过精细淘洗，不含粗大砂粒，在陶坯将干未干时，将表面打磨光亮，然后用红色（赭石）或黑色（锰化物）绘上各种编织纹十子纹、方格纹和花纹或各种动物形象。有时在上彩之前，还涂上一层白色或浅红色的陶衣，使整个画面更为鲜艳。最后放入封闭不很严密的窑中烧制，火候一般高到1000到1400摄氏度之间。陶器因氧化作用而变成红色或红褐色，彩绘纹饰附着在陶器上，洗刷也不会脱落。浙江余姚河姆渡陶器呈黑色，俗称夹炭的黑陶。从石器手工业中开始分化出玉器手工业，在红山文化后期和同时期的许多文化中都出现了玉器。
从距今约1.2万年到距今约5000年约七千年的发展时期，人们一般把它称为新石器时代，它可分为三个阶段，即新石器时代早期（距今约1.2万年到距今约9000年）、新石器时代中期（距今约9000年到距今约7000年）、新石器时代晚期（距今约7000年到距今约5000年），人们不禁要问，到底是在哪个时期，中国思想开始萌芽？
